m6A结合蛋白YTHDF促进应激颗粒的形成
应激颗粒（stress granules，SG），是一种当自身受到氧化应激、热休克和病毒感染等应激的情况下机体为调控信使RNA（mRNA）的翻译和降解而形成的无膜细胞器，主要由翻译停滞的RNA和与RNA具有互作关系的RNA结合蛋白组成。m6A也称N6-甲基腺嘌呤是真核生物中最常见的也是最丰富的RNA修饰，m6A直接参与RNA的代谢过程，比如剪切，核转运，以及RNA转录。
在本文章中，作者发现，m6A结合的YTHDF蛋白与SG的核心组分G3BP1/2蛋白相互作用，并且是SG形成的关键调节因子。通过NaAsO2 诱导细胞氧化应激发现m6A和ploy A信号都强烈的共定位到SG中，并且m6A共定位到SG的数量显著的高于ploy A，在P体中也发现了相同的现象，这表明m6A修饰后的RNA更趋向被募集到SG中。为了验证m6A修饰的mRNA对SG的代谢的影响，通过对SG的RNA测序结果发现，相对较长的信使核糖核酸，m6A的比率与SG的富集呈正相关，并且和SG的耗竭呈负相关。同时发现m6A修饰的YTHDF蛋白与SG颗粒核心蛋白共定位，并且敲除YTHDF蛋白后SG的形成受到了抑制。接下来为了探究YTHDF蛋白的何结构对SG发挥作用，使用NetSurfP-2.0、PLAAC和PONDR-VSL2三种算法对YTHDF蛋白的氨基酸序列和二级结构进行分析，鉴定出YTHDF蛋白的N端的固有无序区(IDR)和YTH区域对SG的形成至关重要。并且证明m6A修饰的YTHDF蛋白会促进SG的形成。接下来，探究YTHDF蛋白究竟如何影响SG的形成的，发现YTHDF敲除后SG形成的核心组分G3BP1簇大小减小。最后，作者通过超分辨率成像发现，即使在非应激的情况下YTHDF和G3BP1也处于超饱和状态，这种状态使他们准备形成超临界簇，从而促进他们在对应激的反应。
doi:10.1038/s41589-020-0524-y.
